科研服務 時間：2020-07-21 15:02:00 瀏覽：11619次
轉錄組測序是基于HiSeq平臺，對待特定組織或者細胞在某個時期轉錄出來的所有mRNA進行測序，即可研究已知基因，亦能發掘新基因，全面快速地獲得mRNA序列和風度信息。
技術路線
案例分析
案 例 通過RNAseq技術全面解析乳腺癌組織中的可變剪切形式
乳腺癌組織由特定形式的轉錄本發揮特殊功能，本研究應用RNAseq技術獲得了三種典型乳腺癌組織TNBC、non-TNBC和HER2陽性乳腺癌的轉錄本信息。該研究發現了新可變剪切形式和可變剪切后的新轉錄本，進一步研究發現，乳腺癌組織與正常乳腺組織在轉錄本表達水平和啟動子轉移水平存在顯著差異，并RT-PCR驗證CDK4，LARP1 , ADD3和PHLPP2等轉錄本形式。該研究第一次系統研究了不同亞型乳腺癌組織轉錄本利用可變剪切形式和轉錄本特異表達的情況。
圖1 三種亞型乳腺癌中可變剪切形式統計
參考文獻
Eswaran J, Horvath A, Godbole S, et al. RNA sequencing of cancer reveals novel splicing alterations [J]. Scientifc reports, 2013, 3.
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